Эльза Санджиевна, как и её мать, оказалась вдовой и вынуждена была заботиться о своем маленьком сыне Эльвеке. В условиях трудного времени, когда надежда на будущее казалась призрачной, она нашла в себе силу не отчаиваться и продолжать борьбу за выживание. Вскоре Эльзу приняли на должность терапевта, а затем она была назначена заведующей врачебным участком и главом поселковой больницы в Саралинском районе, расположенном в Хакасском автономном округе Красноярского края. Этот район славился золотодобывающей промышленностью с множеством шахт и старательских артелей, занимающихся добычей рассыпного золота. Как пишет Газета Элистинская панорама, «Своей самоотверженностью Эльза Санджиевна заслужила большой авторитет среди жителей поселка». Один из ярких случаев, свидетельствующий о её мужестве, произошел, когда она выехала на вызов в артель «Четвертая пятилетка» в сорокаградусный мороз. В это время ее заметил председатель артели Владимир Квинт и, увидев Эльзу в легком пальто и туфлях, немедленно выписал ордер на покупку для неё валенок и полушубка.
Воспоминания Леонида Ковальевича, автора книги «Она служила народу», полны примеров о том, как Эльза добивалась справедливости и помощи для своих пациентов. В одном из случаев, когда ей нужно было отвезти сына и няню во Фрунзе, она столкнулась с отказом райкомендатуры. Однако, благодаря её связям и авторитету, ей удалось добиться разрешения на выезд. Эльза относилась ко всем людям с уважением, независимо от их социального статуса. Её золотое правило заключалось в том, что каждый больной имеет право на лечение. Это касалось не только русских, но и репрессированных калмыков, немцев, финнов и латышей, с которыми она работала.
После демобилизации в 1946 году Эльза Тимошкаева переехала в Киргизию, где ей удалось получить разрешение для своей семьи. В Фрунзе она начала работать в рентгенорадиологическом отделении, где её первыми наставниками были эвакуированные специалисты по онкологии из Москвы и Ленинграда. Вскоре Эльза стала врачом рентгенорадиологического отделения Киргизскогорентгенцентра, который был самостоятельным медицинским учреждением и кафедрой Киргизского медицинского института. Под руководством профессора Зигфрида Блохмана, она работала вместе с другими репрессированными и людям, которые оказались в трудной ситуации.
Эльза Тимошкаева не только работала, но и находила время для культурной жизни — она была частой гостьей театра оперы и балета. Её увлечение классической музыкой и танцами, в частности, вальсом, обогатило её жизнь в Киргизии. Однако, несмотря на успехи в профессии, здоровье Эльзы пошатнулось — ей диагностировали лейкемию. После успешного лечения, она не оставила свою любимую работу, несмотря на советы сменить специализацию.
В 1960 году Эльза вернулась в Элисту, где была назначена главным врачом республиканской больницы. За десять лет её работы на этой должности она создала условия для формирования республиканской онкологической службы. В 1972 году, благодаря её инициативе, был открыт республиканский онкологический диспансер, где она стала главным врачом и фактически организатором онкологической службы Калмыкии. Первоначально диспансер работал в небольшом здании, но позднее, благодаря поддержке Б. Б. Городовикова, были переданы два дополнительных двухэтажных здания, что позволило расширить штат и возможности помощи пациентам.
Эльза Санджиевна всегда подчеркивала важность командной работы и ценности каждого сотрудника, который работал с ней. Она тщательно подбирала коллектив, включая санитарок и врачей, и обеспечивала обучение для многих специалистов. По словам Николая Джимбинова, заслуженного врача РК и хирурга-онколога, «все пришли к ней терапевтами, урологами, рентгенологами, хирургами общего профиля. И всех она сделала онкологами». Эльза Тимошкаева подготовила целую плеяду высококвалифицированных врачей и медсестер, которые продолжили её дело, оставив заметный след в истории онкологической службы республики.